Очевидный минус .NET MAUI — оно не умеет под Linux.
Я бы не стал игнорить Linux. Если конторе нужен некий складского учета и подобного характера софт, компов, скажем несколько сотен — то на одних только лицензиях Windows можно сэкономить десятки тыс. долларов — которые лучше потратить на разработку софта. А работать сама прога будет совершенно идентично на любой ОС. Тем более сейчас проблема с этими лицензиями, их покупкой — сами понимаете какая ситуация.
Еще минус из не очевидных — .NET MAUI у меня тормозит сильнее, Flutter более быстрый. Но тут я не замерял секундомером — тут объективно спорить не готов.
Все остальные решения — не такие универсальные. Есть либо только десктоп как электрон либо React Native — только моб.