Причина 1. Дифференциальная пара. Сигнал в противофазе, помехи синфазные. Подобная схема отлично работает и без завития, и без экрана, что можно наглядным образом наблюдать в плоских лапшеобразных USB–кабелях.

Причина 2. Существует схемотехническая проблема, называемая latch-up. Вкратце: паразитные токи по линиям данных при отключенном питании могут открыть транзисторы непредусмотренным образом, и при подаче питания получаем конское потребление тока, практически КЗ, с сопутствующим перегревом. Есть специализированные защитные решения, но гораздо более простой и дешевый метод борьбы — при подключении сначала коммутировать питание, потом данные. При отключении — наоборот. Загляни в USB-A штеккер. Увидишь, что крайние линии (+5V и GND) чуть длиннее, чем средние (D+, D-). Именно по этой причине.

На мой взгляд, этих двух нюансов достаточно для того, чтобы USB 1 и 2 были устроены именно так, а не иначе.