Здравствуйте, Mamut, Вы писали:

_>> Стоп-стоп. Какой ACID? Если для DDL его нет. Тут уже упоминали .frm файлы.
M>Ну, он в теории есть. По идее frm ожно восстановить по transaction-логам. Но это — в теории

Не знаю, как щас, но год-полтора назад ситуация была следующая:
1) запускаем скрипт, в единой транзакции обновляющий структуру базы;
2) скрипт выбрасывает исключение;
3) транзакция откатывается, включая изменения метаданных, хранимых и используемых innodb, но НЕ включая изменения в frm-файлах, используемых ядром мускуля (в т.ч. планировщиком ЕМНИП);
4) все последующие запросы к таблицам, метаданные которых рассогласованы, падают с внутренней ошибкой;
5) делаем /etc/init.d/mysqld stop;
6) ручками или скриптиком восстанавливаем frm-файлы (в документации мускуля было howto);
7) делаем /etc/init.d/mysqld start;
8) не забываем повторять про себя "во б#$% п#$#$# е#$#$#$ е#@#@ их в с#$#%# что б вы м#$^@ п#$#$%#$# cо своим е#$&@# муcкулем!" в течение всего процесса, начиная с пункта 4 (можно раньше).