а где искать заказы на разработку софта в сфере биоинформатики и всего что вокруг него в ту или иную сторону?
имеются в виду заказы на несколько человеко-месяцев или человеко-лет

я свои крупнейшие заказы такого размера в сфере разработки обычного бизнес-софта нашел простейшим образом
1. один через массовую рассылку резюме в несколько тысячах писем по мелким североамериканским компаниям
2. другой через нетворкинг

оба раза заказы сначала выглядели крошечными на пару месяцев, а потом они начали расти и расти и расти
(все остальное был либо мелкий фриланс либо работа в офисе)

знакомые биологи есть, но это все академическая сфера, а не индустрия
заказы хочется найти большие большие, чтобы реализовать их как пм с наемниками, а не как девелопер
идти на работу в офис не планируется

вариант с расширением круга контактов обычными методами очевиден

что-то еще?
если спамить, то кого?

А>что-то еще?
А>если спамить, то кого?

продолжим рассуждать вслух (это помогает искать ответ самому, даже если никто из читающих не отвечает)

исходя из опыта разработки бизнес софта, заказчик должен быть "не в зуб ногой" в айти технологиях (иначе зачем я ему нужен??? он пойдет к более опытным)
но при этом эти технологии должны быть ему позарез нужны
и при этом заказчик должен быть все таки не идиотом и понимать, что за работу надо платить большие деньги и "тяп ляп" ему не нужен

очевидно, нужен каталог с контактами биологов разных специализаций

пока я нашел хорошие подборки контактов нескольких нужных мне специализаций только в 2х местах
1. один хороший американский сайт знакомств (оп-ля! да еще и с фотками) — к сожалению никто не ответил
2. линкедин — там во первых надо платить за рассылку, во вторых все равного много не нарассылаешь, в третьих народ плохо отвечает
однако и то и другое позволяет так сказать посмотреть в лицо потенциальным клиентам, а заодно изучить их жизненные пути и психологию

продолжаем думать дальше и ждать идей от читателей

Здравствуйте, Аноним, Вы писали:

А>>что-то еще?
А>>если спамить, то кого?

А>продолжим рассуждать вслух (это помогает искать ответ самому, даже если никто из читающих не отвечает)

А>исходя из опыта разработки бизнес софта, заказчик должен быть "не в зуб ногой" в айти технологиях (иначе зачем я ему нужен??? он пойдет к более опытным)

казалось бы странно, как это заказчик в такой теме может быть не в зуб ногой
однако, как пишет в одной из своих книг Певзнер еще несколько лет назад — это было скорее правилом, чем исключением

так что это правильный подход в принципе даже в этой области

Почему именно биоинформатика? Направление достаточно экзотическое, а основные потребители сосредоточены в академической сфере...

Здравствуйте, serjjj, Вы писали:

S>Почему именно биоинформатика? Направление достаточно экзотическое, а основные потребители сосредоточены в академической сфере...
Ещё туда же идут разные компании типа Монсанто, которые занимаются выведением новых сортов растений, борьбой с вредителями и т.п. Это уже немалый рынок.

Но сейчас начнётся эра клинического секвенирования — оно почти стало доступным. Тогда откроется огромная и весьма вкусная отрасль с большим количеством денег.

Здравствуйте, Аноним, Вы писали:

А>казалось бы странно, как это заказчик в такой теме может быть не в зуб ногой
А>однако, как пишет в одной из своих книг Певзнер еще несколько лет назад — это было скорее правилом, чем исключением
Это именно так. Проблема в том, что множество хороших молекулярных биологов и хороших программистов имеет очень маленькое пересечение.

Потому сейчас очень мало нормального софта в биоинформатике.

Скажем, самый частоиспользуемый браузер — это IGV ( http://www.broadinstitute.org/igv/home ) на который без слёз смотреть сложно (а уж если заглянуть в код..). Нормальная компания, делающая недорогой, удобный и расширяемый браузер может неплохо подзаработать. Например, есть компания, которая живёт просто за счёт того, что производит aligner ( http://www.novocraft.com/main/index.php ), который работает немного лучше BWA.

Насчёт продвижения — сейчас индустрия маленькая, и имеет смысл продвигаться через конференции (PWMC, IGBT, ECCB и т.д.). Идеально там сделать свой стэнд, но даже просто пройтись и вручить свои визитки потенциальным клиентам тоже поможет.

S>>Почему именно биоинформатика? Направление достаточно экзотическое, а основные потребители сосредоточены в академической сфере...
C>Ещё туда же идут разные компании типа Монсанто, которые занимаются выведением новых сортов растений, борьбой с вредителями и т.п. Это уже немалый рынок.

Если ширпотребный бизнес-софт это 100%, то сколько процентов будет биоинформационный софт в академической и околоакадемической сфере?

C>Но сейчас начнётся эра клинического секвенирования — оно почти стало доступным. Тогда откроется огромная и весьма вкусная отрасль с большим количеством денег.

Тут я согласен. Пока не наступит стадия "избавление от иллюзий" денег жалеть не будут. Но с другой стороны, сколько клиник будет заказывать написание софта? Может проще купить уже готовое комплексное решение (химия-железо-софт)? А разработчики комплексных решений много ли заказывают софта у независимых разработчиков?

Здравствуйте, serjjj, Вы писали:

S>Почему именно биоинформатика? Направление достаточно экзотическое, а основные потребители сосредоточены в академической сфере...

у меня часть родственников из медицинско-химической сферы, часть из академической, часть из государственной, инженерной и финансовой
сам я по натуре бизнесмен
так что это всего лишь унаследованный тип мышления

Здравствуйте, serjjj, Вы писали:

S>Тут я согласен. Пока не наступит стадия "избавление от иллюзий" денег жалеть не будут. Но с другой стороны, сколько клиник будет заказывать написание софта? Может проще купить уже готовое комплексное решение (химия-железо-софт)? А разработчики комплексных решений много ли заказывают софта у независимых разработчиков?

это по поводу покупки комплексных решений на уровне больших заказов
http://alexmoskalyuk.livejournal.com/1249849.html

Здравствуйте, Аноним, Вы писали:

А>что-то еще?

Craiglist

Здравствуйте, serjjj, Вы писали:

C>>Ещё туда же идут разные компании типа Монсанто, которые занимаются выведением новых сортов растений, борьбой с вредителями и т.п. Это уже немалый рынок.
S>Если ширпотребный бизнес-софт это 100%, то сколько процентов будет биоинформационный софт в академической и околоакадемической сфере?
Очень мало. Однако, бизнес-софт — это уже очень развитая область, очень нелегко найти свою нишу.

S>Тут я согласен. Пока не наступит стадия "избавление от иллюзий" денег жалеть не будут. Но с другой стороны, сколько клиник будет заказывать написание софта? Может проще купить уже готовое комплексное решение (химия-железо-софт)? А разработчики комплексных решений много ли заказывают софта у независимых разработчиков?
Дело в том, что "комплексных решений" просто-напросто нет. Далее, сами по себе устройства секвенирования выдают сырые данные — с ними надо что-то делать. Тут тоже очень непаханное поле.

C>>>Ещё туда же идут разные компании типа Монсанто, которые занимаются выведением новых сортов растений, борьбой с вредителями и т.п. Это уже немалый рынок.
S>>Если ширпотребный бизнес-софт это 100%, то сколько процентов будет биоинформационный софт в академической и околоакадемической сфере?
C>Очень мало. Однако, бизнес-софт — это уже очень развитая область, очень нелегко найти свою нишу.

А в биоинформатике для программистов легко? Да и вообще, если умножить на ноль, то ноль и получится...

S>>Тут я согласен. Пока не наступит стадия "избавление от иллюзий" денег жалеть не будут. Но с другой стороны, сколько клиник будет заказывать написание софта? Может проще купить уже готовое комплексное решение (химия-железо-софт)? А разработчики комплексных решений много ли заказывают софта у независимых разработчиков?
C>Дело в том, что "комплексных решений" просто-напросто нет. Далее, сами по себе устройства секвенирования выдают сырые данные — с ними надо что-то делать. Тут тоже очень непаханное поле.

Почему их не делают крупные фирмы (те же производители секвенаторов)? И ресурсы есть, и бренд есть. Может не все так просто?

1. Сами производители секвенаторов не верят, что все будет так хорошо как они обещают в своей же рекламе.

2. Что там с сертификацией? Медицинская диагностика это не шубохранилище, тут могу люди умереть. Может ли мелкий коллектив программистов это осилить технически/юридически/финансово? Тем более если это заказ т.е. каждый раз начинать процедуру заново.

3. Допустим отсеквенировали, собрали, аннотировали. А дальше что? Любоваться красивыми стрелочками в "недорогом, удобным и расширяемом браузере"? Практической пользы в этом особой нет. Нужны базы данных заболеваний. Не получится ли так, что в софте за 100000 долларов — 50 долларов сам программный код и 99950 долларов базы данных?

4. Есть ли эти базы вообще? Под какой лицензией? Есть базы моногенных заболеваний, но основные моногенные заболевания уже сейчас можно диагностировать ПЦРом вообще без секвенирования (даже без классического). А как быть с полигенными заболеваниями/предрасположенностями/реакцией на лекарства? Без этого софт получится как Лингво без словарей.

ИМХО, мелкие коллективы программистов способны решить только маленькие кусочки глобальной проблемы, а больницы не захотят собственноручно собирать легого на свой страх и риск.

Здравствуйте, serjjj, Вы писали:

C>>Очень мало. Однако, бизнес-софт — это уже очень развитая область, очень нелегко найти свою нишу.
S>А в биоинформатике для программистов легко? Да и вообще, если умножить на ноль, то ноль и получится...
Да, легко. Сейчас банально их очень мало. Причём биоинформатика становится очень денежной областью.

C>>Дело в том, что "комплексных решений" просто-напросто нет. Далее, сами по себе устройства секвенирования выдают сырые данные — с ними надо что-то делать. Тут тоже очень непаханное поле.
S>Почему их не делают крупные фирмы (те же производители секвенаторов)? И ресурсы есть, и бренд есть. Может не все так просто?
Ну как-бы до недавнего времени я работал в ведущем производителе секвенаторов (на букву I) после того, как они купили наш стартап. То что мы в стартапе делали за месяц — в большой компании делают год. Ну и просто хороших программистов там очень мало, большая часть персонала занята разным железно-химическим R&D или работает в сервисах.

S>2. Что там с сертификацией? Медицинская диагностика это не шубохранилище, тут могу люди умереть. Может ли мелкий коллектив программистов это осилить технически/юридически/финансово? Тем более если это заказ т.е. каждый раз начинать процедуру заново.
Сертификация в FDA больше относится к железкам — там полная задница. Для софта всё существенно проще. А если заниматься только научными применениями — вообще ничего не надо.

S>3. Допустим отсеквенировали, собрали, аннотировали. А дальше что? Любоваться красивыми стрелочками в "недорогом, удобным и расширяемом браузере"? Практической пользы в этом особой нет. Нужны базы данных заболеваний. Не получится ли так, что в софте за 100000 долларов — 50 долларов сам программный код и 99950 долларов базы данных?
Действительно, есть компании, которые делают курируемые базы мутаций ( http://www.svbio.com/ — из моих знакомых). Там софт часто вообще писать никто не умеет. Так что вполне реально как раз им продавать лицензии.

S>4. Есть ли эти базы вообще? Под какой лицензией? Есть базы моногенных заболеваний, но основные моногенные заболевания уже сейчас можно диагностировать ПЦРом вообще без секвенирования (даже без классического). А как быть с полигенными заболеваниями/предрасположенностями/реакцией на лекарства? Без этого софт получится как Лингво без словарей.
Базы снипов есть ( http://genome.ucsc.edu/ ), в public domain, для диагностики простых болезней достаточно. Для более точной диагностики нужно по-хорошему иметь секвенированный геном, ещё лучше сфазированный (разделённый между парами хромосом).

Из интересных и клинически важных областей, которые станут возможными: HLA typing, реакция на варфарин, предрасположенность к раку. Онкогенетика вообще активно развивается последние годы.

S>ИМХО, мелкие коллективы программистов способны решить только маленькие кусочки глобальной проблемы, а больницы не захотят собственноручно собирать легого на свой страх и риск.
Вот поэтому как раз будут пользоваться успехом инструменты для "документоборота" генетических данных. Там конкретной сложности немного — это типичные учётные приложения, но их сейчас просто нет. Туда же инструменты для автоматизации лабораторий (LIMS).

Здравствуйте, Аноним, Вы писали:

А>а где искать заказы на разработку софта в сфере биоинформатики и всего что вокруг него в ту или иную сторону?
А>имеются в виду заказы на несколько человеко-месяцев или человеко-лет

Как человек, работающий в данной области скажу, что
1) в России рынка почти нет
2) По отчётам CLCBio биоинформатика это 60% академия (по рынку)
3) От всего остального сильно отличается необходимостью разбираться в предмете. (Сравнить наверно можно с матмоделированием в физике)
4) Нужно уметь аналитику. Желательно аналитику больших данных
5) "Простые программы" пока не очень нужны ибо академия не сильно заморачивается, клиники (даже в США) только начинают, фарма любит делать через академию. Хотя, несомненно, тренд есть.

Ну и как всегда, если у вас есть имя и умение, то работу вам, скорее всего, предложат. Скорее всего из академии или из академии, ушедшей в стартап.