ЕМ>Я использую минимальные дистрибутивы (embeddable package). Оказалось, что они не принимают во внимание переменные среды. С одной стороны, это логично, а с другой — могли бы хоть словом упомянуть это

По твоей же ссылке https://docs.python.org/3.11/using/windows.html#windows-embeddable это упомянуто:
> the embedded distribution is (almost) fully isolated from the user’s system, including environment variables

ЕМ>Были б у них или адекватная документация

Как видишь, она есть. Неадекватным оказался читатель.