В каком то журнале вычитал, что при инсталляции сборок из MSI, они регятся в GAC, относится ли это к прокси СОМ+ приложений. И еще вопрос, до дотнет dll проинсталленные как прокси на клиенте ложились в Program Files\COM+ applications\{GUID}\, а сейчас куда (скорее всего в GAC, но не уверен).