Добавил флаг Deterministic, убрал отладочную информацию. И все равно некоторые сборки получаются разными при сборке на моей машине и на том же Appveyor. Причем некоторые одинаковые а некоторые разные. Т.е. идея правильная, раз некоторые одинаковые.

Это вообще работает? Что посмотреть? В чем может быть проблема?