Здравствуйте, Serginio1, Вы писали:

S> Хотя копирую те же сборки, что и в приложении. Может ей xx.deps.json нужен для приложения?

И в сотый раз — я не занимаюсь сейчас нативом, хостингом CLR и уж тем более не работаю с 1с
Так что все мои советы сводятся к погуглить в основном.

Начать можно с следующего:
1. Смотрим
http://www.fancy-development.net/hosting-net-core-clr-in-your-own-process

The values we have to provide are the
◾"APPBASE" — Base path of the application, think of it as the execution directory of the application
◾"TRUSTED_PLATFORM_ASSEMBLIES" — A list of paths to assembly files which will be fully trusted by the runtime. Here we have to list all assemblies which have unsafe .NET Code blocks or use PInvode for interop because those assemblies are only executed if they are fully trusted. Separate the file paths with a semicolon. The file paths need to be absolute.
◾"APP_PATHS" — The paths where the Core Clr looks for referenced assemblies to load. Separate the file paths with a semicolon. The file paths need to be absolute.

Если не оно:

2. Проверяем актуальную реализацию вот тут

3. Читаем документацию, где нет — спрашиваем вот тут.