хотелось бы чтоб программа сама определяла имена всех сборок которые она использует, сверяла версии их у себя и на сервере и при необходимости закачивала новые версии с сервера...
вопрос:
как програмно получить имена всех сборок участвующих в проекте?

Через Reflection, Точнее через AppDomain.

    AppDomain currentDomain = AppDomain.CurrentDomain;
    //Make an array for the list of assemblies.
    Assembly[] assems = currentDomain.GetAssemblies();

    //List the assemblies in the current application domain.
    Console.WriteLine("List of assemblies loaded in current appdomain:");
            foreach (Assembly assem in assems)
                    Console.WriteLine(assem.ToString());

Это определит только те сброки которые загружены на данный момент, а что бы вообще все которые используются,
дописать кусок кода с использованием assem.GetReferencedAssemblies()

Лучше повесь handler на AppDomain.ResolveAssembly. В случае отстутсвия загружай с сервера в отдельную папку и при старте сверяй версии сборок в этой папке-кеше у сервера.