Привет, мне нужно массово обрабатывать некоторые файлы, в некоторой папке/подпапках

Часто структура папок и подпапок от обработки к обработке данных отличается. Иногда нужно обрабытывать не все файлы — иногда файлы в подпаке только верхнего уровня, в подпапках проигнорировать, иногда наоборот и т.д.

В какой форме в программе проще всего задавать "фильтр" необходимых файлов, что бы можно было его как настройку сохранить? Что вы можете мне посоветовать? Regex?