Поробовал сделать вот так:
Database.SetInitializer(new MigrateDatabaseToLatestVersion<LCCheckpointContext, Configuration>());
Вот файлы конфигарции:

    public sealed class Configuration : DbMigrationsConfiguration<LCCheckpointContext>
    {
        public Configuration()
        {
            AutomaticMigrationDataLossAllowed = true;
            AutomaticMigrationsEnabled = true;
            ContextKey = "LCCheckpointContext";
        }
        protected override void Seed(LCCheckpointContext context)
        {

        }
    }

    public class RequestConfiguration : EntityTypeConfiguration<LCRequest>
    {
        public RequestConfiguration()
        {
            ToTable("LCRequests");

        }
    }

Всё равно не работает.
ТОлько ошибка теперь другая
{"Invalid object name 'dbo.LCRequests'."}
Те получается EF не создаёт таблицы, а хочет, что бы они уже были там.