Здравствуйте, Qbit86, Вы писали:

Q>С чем это может быть связано, есть ли какие-то общие рекомендации, или это проблемы конкретных скриптов сборки?

Возможно в одном из проектов стоит что-то типа:

<Reference Include="Core">
  <Private>False</Private>
</Reference>