Здравствуйте, vsb, Вы писали:

vsb>В приложении один из потоков вызывает native код, который может блокироваться (до нескольких десятков секунд). При завершении приложения хочется завершить его максимально быстро.

При завершении приложения (процесса Windows) все потоки завершаются автоматически.