Пишем код:

    class A
    {
        private int myVar;

        public int MyProperty
        {
            get { return myVar; }
            set { myVar = value; }
        }
        public A( int var)
        {
            myVar = var;
        }
        public override bool Equals(object obj)
        {
            A instance = obj as A;
            return instance !=null?instance.MyProperty == this.MyProperty:false;
        }
    }
    class Program
    {
        static void Main(string[] args)
        {
            List<A> ACollection = new List<A>();
            A A1 = new A(1);
            ACollection.Add(A1);
            ACollection.Add(new A(2));
            ACollection.Add(new A(3));
            A A2 = new A(1);
            ACollection.Add(A2);
            ACollection.Remove(A2);

        }
    }

После выполнения ожидается что в результирующея коллекция будет иметь вид:
A(1)
A(2)
A(3)

НО НА САМОМ ДЕЛЕ ОНА ИМЕЕТ ВИД:
A(2)
A(3)
A(1)