Здравствуйте, k_2, Вы писали:
k_2>Все работает на localhost и не работает в интранете
k_2>От каких настроек зависит? на IIS уже вроде все настройки перепробовала
От IIS практически не зависит.
Насколько я понял, то не работает не все, а именно процедура входа после выхода.
Проблема скорее всего в куках.
Попробуй в Global.asax в обработчике Application_AuthenticateRequest посмотреть на коллекцию Context.Request.Cookies.
Из чего она состоит?
На серваке, на котором все неработает стоит один экземпляр приложения?
Если нет, то надо чтоб у каждого экземпляра приложения название кук были разные. Можно еще попробовать ограничивать куки по пути. Например:

<authentication mode="Forms">
   <forms loginUrl="logon.aspx" name="pid_auth_1" timeout="60" path="/pid_app_1" />
</authentication>