для mvc контроллера куки посылаются номарльно и User.Identity.Name значение задано. если в адресе передавать разный параметр (что бы не было кеширования) — то куки в ответе есть, но на сервере User.Identity.Name == null все равно
запрос делаю так

            $.ajax({
                method: 'GET',
                url: '@Url.RouteUrl("DefaultApi", new { httproute = "", controller = "Number" })' + '?serviceId=' + serviceId + '&time=' + new Date()
            })

ссылка