Здравствуйте, Juric, Вы писали:

J>Добрый день.

J>Мне нужно зарегистрировать в IIS для определённой виртуальной директории обработчик.
J>Обычно можно в диалоговом окне Application Configuration добавить Extension (Application Mappings)
J>для обработчика, а как это можно сделать программно?
J>Спасибо.

в web.config для твоей virtual Directory в секцию system.web:

           <httpHandlers>
            <add verb="GET" 
                path=".myExt" 
                type="(class), (assembly)" />
                
        </httpHandlers>