Здравствуйте, Masterspline, Вы писали:

M>...

Здесь подробнее, охватывая разные файловые системы: https://softwareengineering.stackexchange.com/questions/301400/why-is-the-git-git-objects-folder-subdivided-in-many-sha-prefix-folders . + такие директории можно симлинковать по отдельности в случае необходимости.