1)К базе данных можно подключится удалённо и использовать сразу несколько соединений...
наверное запрос для разных соединений атомарен ? только где это написано?
2)Обязательно ли останавливать работу с БД когда делаешь дамп через
https://github.com/MySqlBackupNET/MySqlBackup.Net в отдельном соединении?