Здравствуйте, ctapik, Вы писали:

C>На машине есть ком-порт с ним работает приложение. Необходимо сделать так чтобы этот ком-порт отключить а потом включить(наподобии того как это сделано в Device Manager/Ports/Communication port/Disable(Enable)). Как это можно сделать програмным путем? Заранее благодарен.

ComPort в Винде открывается как обычный файл с помощью HANDLE hFile=CreateFile(...).
Попробуй выяснить хендл и далее используй CloseHandle(hFile) для закрытия порта. Может получится.