Есть такая славная утилитка sync от Sysinternals, которая сливает недозаписанные буферы для всех дисков. Работает через FlushFileBuffers, открывая том "по букве".

Однако непонятно, что происходит, когда некоторые тома смонтированы не на буквы, а в mount point'ы на томах NTFS. Когда на "хостовый" том выдается FlushFileBuffers — буферы этих подмонтированных томов тоже сливаются, или нет? А если нет — как можно организовать их дозапись?