Здравствуйте, iFil, Вы писали:

F>Имеется самодельное PCI устройство без функций мастера (контроллер PCI — на ПЛИС Altera). Устройство имеет 32к памяти, которую необходимо читать (желательно быстро).
F>...среднее время чтения (movsd) — 4550 мс. В других вариантах ...скорости порядка 6000 — 9000 мс.

Это получаются секунды что ли? Если это так, то, ИМХО, в сторону устройства копать нужно, т.к. тормозит оно.